Откуда появился коронавирус. И другие новости по теме

Есть три версии происхождения вируса

В социальных медиа распространились слухи о том, что SARS-CoV-2 мог быть создан в лаборатории. Такое же мнение высказывали и некоторые политики — например, Том Коттон, выпускник юридического факультета Гарварда и сенатор штата Арканзас с 226 тысячами подписчиков в Твиттере.

Для проверки этого мифа команда ученых из США, Англии и Австралии сравнили геномные данные альфа- и бета-коронавирусов (две подгруппы из семейства, которые поражают млекопитающих), чтобы понять основные структурные и биохимические параметры SARS-CoV-2.

Рецептор-связывающий домен белка-«шипа», который помогает вирусу проникнуть в клетку — наиболее вариативная часть коронавирусного генома. 6 аминокислот в его составе критичны для связывания с рецептором белка ACE2 на поверхности легких, артерий, сердца, почек и кишок — именно аминокислоты различаются у вирусов с разными животными-хозяевами. Компьютерная симуляция, проведенная учеными, показала, что рецептор-связывающий домен белка-«шипа» на поверхности SARS-CoV-2, связывается с человеческим ACE2 с довольно высокой аффинностью (силой взаимодействия), но далеко не оптимальной.

Это очень сильный аргумент в пользу того, что структура домена развилась в результате естественного отбора, а не специального сконструирована в лаборатории. 

Вторая особенность COVID-19 — область аминокислот на стыке двух частей белка- «шипа», так называемый сайт расщепления. От состава и последовательности аминокислот в этой области зависит взаимодействие белка с клеточными мембранами. У SARS-CoV-2 особая структура сайта расщепления, которая не наблюдается в родственных бета-коронавирусах и может влиять на распространение и патогенез коронавируса. Причина таких особенностей, как правило, — естественный отбор.

В статье ученые также приводят три возможные гипотезы возникновения вируса.

1. Естественный отбор в животном-хозяине → передача от животного к человеку 

Некоторые источники утверждают, что первые случаи заболевания SARS-CoV-2 связаны с рынком Хуанань в Ухани. Учитывая схожесть COVID-19 человека с вирусом летучей мыши, предполагается, что он передался именно от них. Однако несмотря на 96-процентное сходство, рецептор-связывающий домен белка-«шипа», у них отличается. Это позволяет предположить, что белок на поверхности вирусной частицы летучей мыши не смог бы эффективно связываться с ACE2 человека.

Вирус второго предполагаемого источника, малайзийского панголина, похож на человеческий и составом рецептор-связывающего домен белка-«шипа», — у них одинаковые 6 ключевых аминокислот. Однако ни у летучей мыши, ни у панголина нет многоосновного сайта расщепления, присутствующего в SARS-CoV-2 человека (мутации, вставки и удаления в нем только подтверждают его возникновение в результате естественного отбора). 

2. Естественный отбор в человеке после передачи от животного 

Возможно, что вирус был получен человеком от животных, и приобрел новые черты, передаваясь от человека к человеку. Скопление адаптаций могло послужить началом пандемии. Все геномы SARS-CoV-2 обладают общим набором черт — это позволяет предполагать, что они произошли от общего предка. Этим предком мог быть коронавирус панголина. 

3. Отбор в результате культивирования клеточных культур 

Коронавирус летучей мыши культивировали в клетках и подопытных животных в лабораториях по всему миру на протяжении многих лет. И да, были документированные случаи заражения вирусами из семейства коронавирусов в результате лабораторной ошибки — SARS такого происхождения нашли у студента микробиологической лаборатории Национального университета Сингапура в 2004. 

Поэтому теоретически возможно, что и мутации домена  SARS-CoV-2 произошли в результате его многократного культивирования в клетках. Однако вариант панголинов с практически идентичным доменом выглядит намного более правдоподобным вариантом. Вдобавок, место для возможного присоединения О-связанных гликанов вряд ли развилось в результате лабораторного культивирования вируса. Оно скорее возникло в результате взаимодействия с иммунной системой «жертвы». 

Для лучшего понимания, как развивался вирус, необходим анализ его генома у зараженных на ранних стадиях развития пандемии. 

Потеря обоняния и вкуса может войти в список симптомов COVID-19

Человеческий нос может распознать примерно триллион запахов с помощью 400 ольфакторных рецепторов — эта способность может нарушаться при заражении коронавирусом.

По мартовскому отчету Британской ассоциации отоларингологов для Королевского общества хирургов Англии, аносмия (потеря обоняния) случается в 40% вирусных инфекций.

В нем также приводится информации о растущем количестве данных из разных стран о том, что и у пациентов с коронавирусом наблюдается потеря обоняния. Есть также информация о людях с положительным диагнозом, у которых не было иных симптомов заболевания, кроме потери обоняния и вкуса. Доктора из госпиталя университета Бонна заявляют, что 70% из более 100 пациентов с COVID-19 жалуются на отсутствие вкуса (агевзия) и обоняния на протяжении нескольких дней.

В отчете также говорится о том, что людям, замечающим аносмию и агевзию, рекомендуется семидневная самоизоляция, чтобы исключить возможность стать бессимптомными векторами распространения коронавируса.