Айцішнік напісаў першы беларускамоўны посткіберпанк-раман. Пра што?
Support us

«Это может быть началом великого конца». Микробиолог — о технологиях в науке

4 комментария
«Это может быть началом великого конца». Микробиолог — о технологиях в науке

Биолог Ольга Шаповал, родом из Барановичей, занимается микробиологией и анализом данных, полученных в лаборатории. В Скандинавию она переехала 11 лет назад, защитила там докторскую диссертацию, а теперь помогает белорусским аспирантам получить междисциплинарное образование в Норвегии. dev.by узнал у выпускницы биофака, какой научной фантастикой она занимается в своей лаборатории.

Читать далее

Как страх остаться учителем привёл в Лундский университет

В микробиологию она попала случайно. Хотела поступать на медицинский факультет, но выбрала биологический и не пожалела: окончила один белорусский вуз и два европейских, став доктором наук. «Медицина — это всё-таки рутина, понимаю я это, правда, только сейчас. После биофака я боялась остаться работать в школе учителем, но, к счастью, этого не случилось. Сейчас я полностью на своём месте: нахожусь с исследовательской стороны и участвую в разработке новых методов и подходов в биологии».

После выпуска из первой альма-матер Ольга два года отработала по распределению инженером-микробиологом на заводе газированных напитков АкваTрайпл. После университета ей хотелось попасть «в индустрию, в реальную лабораторию на реальный завод». Но, когда задачи стали однотипными (каждый день образцы и анализ), вернулась в аспирантуру. Получила грант от шведского университета и отправилась в Скандинавию.

— В Швеции есть студенческий городок (около 90 процентов его жителей — студенты), расположенный прямо на границе с Данией, называется Лунд. В нём находится один из лучших по мировым масштабам университет — Лундский. Когда я училась в Беларуси, то, можно сказать, ещё не знала, что такое атмосфера университета. А там, когда выходишь с вокзала, сразу видишь, что повсюду — студенческие здания, немыслимо огромный университетский кампус с множеством факультетов. Университет старый, и в нём, можно сказать, хранится древняя культуру вуза: там учились многие именитые учёные.

В Швеции Ольга продолжила исследовать тему, начатую в Беларуси, но немного в другом формате. На биофаке она занималась бактериофагами — вирусами, способными уничтожать фитопатогенные бактерии, а в Лундском университете — микробами, которые могут разлагать токсичные отходы: «Это было незабываемое время, студенческие годы — самые лучшие. Скандинавская система — это система команды, а не индивидуалистов. Именно там я научилась работать в команде. Обычно этому нигде не учат, и мы растём индивидуалистами, а скандинавы — командные игроки».  

После окончания Лундского университета белоруска пыталась найти работу в Швеции, но в индустрию попасть ей не удалось — необходимо было свободное владение шведским языком. Поэтому приняла приглашение от норвежского вуза: «А почему бы нет? Норвегия хорошая, тихая страна, близкая по культуре к Швеции, к которой я уже успела привыкнуть».

Так белоруска получила позицию в аспирантуре Норвежского университета естественных и технических наук и параллельно училась в другом частном исследовательском институте: «Моя карьера складывалась довольно странно. Даже папа говорил, когда ты уже начнёшь работать, ты ведь всё время учишься. А я так скажу: всё, что со мной происходило, — это ряд определённых случайностей и шансов, которые мне выпадали, и я от них не отказывалась».

Микробное масло как альтернатива оливковому: готовы ли вы купить бутылочку?  

Исследования белоруски, а их немало, находятся на стыке биологии, физики и прикладной математики. Основная тема, над которой она работает уже около 11 лет — разработка новых нестандартных методов в биологии, основанных на биофизических подходах: «Это более быстрые и эффективные методы, один из них — инфракрасная спектроскопия. Большинство методов принадлежит области биофизики: использование лазеров инфракрасного света. С помощью инфракрасной спектроскопии можно идентифицировать микроорганизмы».

Скандинавские страны обеспокоены тем, что окружающая среда сильно загрязнена: «Индустрия платит большие налоги на отходы, поэтому заинтересована в поиске альтернативных методов их утилизации. Учёные, в том числе и я, исследуем это направление и пытаемся найти решение».

— В одном из моих проектов я изучаю особые микроорганизмы, которые могут производить большое количество жира из потребляемых пищевых отходов. Добывается он так же, как и в случае с растениями: сперва получают биомассу, а потом химическим путём экстрагируют из неё жир. По химическому составу микробный жир идентичен натуральному, а, возможно, и лучше. Его можно рассматривать как альтернативу оливковому маслу или рыбьему жиру.

Фото из личного архива героини

По словам Ольги, людям психологически сложно такое принять, поскольку «привычка свыше нам дана». Но в Норвегии исследователи «просвещают» граждан, публикуя научно-популярные статьи о разработках в этой области. «Если мы не будем работать над альтернативными способами добычи необходимых для жизни продуктов, то нашим детям мало, что достанется — мы всё потребим за свою жизнь. Поэтому есть смысл возвращать отходы через биологический процесс в пищевую цепь».

К тому же, по словам учёного, продукты, которые можно вернуть в цепь, имеют большую ценность, чем, скажем, биодизель, биотопливо или биопластик. А в Европе с 2013 года огромное финансирование отводится на исследования и поиск альтернативных источников энергии.

Стартап в области контроля качества и робот-лаборант

— После аспирантуры в Норвегии мы с преподавателем основали стартап MWT-Analytics AS, который связан с разработкой софта для микробиологического контроля качества продуктов. Алгоритмы этого решения созданы на данных, которые я собирала в течение 10 лет. Наш метод мощнее и быстрее существующих, может проанализировать огромное количество образцов и даже заменить специалистов, проводящих контроль качества.

Для французского госпиталя биолог разрабатывает решение для быстрой идентификации патогенных дрожжей. Также есть проекты по робототехнике: «Мы создали робота, который делает подготовку микроорганизмов для анализа инфракрасной спектроскопии. Робот может подготовить до 1000 образцов в день, человеку такое не под силу».

Как правило, на любом проекте есть экспериментальная часть (проводится биологами и химиками) и практическая — когда математик получает пакет данных, например, спектры или фотографии с микроскопов и их анализирует: «Математик не может анализировать данные, не понимая, как они были получены. Поэтому одни специалисты плотно контактируют с другими. Биолог начинает исследование, а математик — завершает. Я пытаюсь сидеть на трёх стульях: сама биолог, но всё больше понимаю физиков и математиков».

Начало либо великого конца, либо великого продолжения

По словам доктора естественных наук, в биологии уже накопилась критическая масса данных, которые невозможно обработать без современных методов анализа: «Боюсь, что мы слабо себе представляем, что можем получить, проанализировав их все. Думаю, это начало либо великого конца, либо великого продолжения».   

— Когда мы снимаем тысячи инфракрасных спектров, ставим клетку в разные условия, то именно такие методы, как Machine Learning, помогают понять и интерпретировать полученные данные. Возможно, только сейчас биологи смогут многое объяснить на концептуальном уровне, посмотреть на науку с высоты. Долгое время мы занимались деталями, а с помощью высоких технологий может быть сможем увидеть то, чего не видели раньше.

В микробиологию уже проникли такие современные веяния, как Big Data Analysis. Команда Ольги сотрудничает с университетами в области генной инженерии и генной модификации организмов. Кроме утилизации отходов соотечественнице интересна сфера антибиотикорезистентности: «Эта область актуальна, поскольку во многих странах использование антибиотиков не регулируется вовсе. Насморк — попей антибиотики. А это неправильно».  

Нет чисто биологии или математики — есть биоматематика

Анализ данных — ещё одно направление, которым интересуется биолог: «Я сначала снимаю спектры, а потом сама их анализирую. Не то чтобы я не доверяла их кому-то, просто мне нравится работать со своими данными. Когда много времени проводишь в лаборатории, то всегда интересно узнать, что в итоге получилось».

Для этого Ольге пришлось освоить математические приёмы анализа данных: Principal component analysis (PCA), Partial least squares regression (PLS regression), Neural Network.

— Я понимаю, какую силу имеют ИТ-технологии. Могу прочитать код, применить его для своих задач, если нужно — что-то в нём изменить. Знаю, что многие биологи переходят в программисты, но мне нравится быть биологом. При этом я хочу больше понимать математические методы, чтобы использовать их в своей работе. Я восхищаюсь программистами, но мне ближе экспериментальная работа. Люблю, когда в лаборатории что-то происходит: микроорганизмы растут, меняют цвет, что-то производят, и я вижу это в микроскопе. Для меня это целая жизнь, без этого я не могу понять биологию.

По словам Ольги, мультидисциплинарность — это сейчас популярное направление в Европе: «В природе всё сбалансировано, и, возможно, собрав всё вместе (физику, химию, биологию, математику), мы сможем понять, как она устроена. Бывает, что биолог задаёт глупый с точки зрения физика вопрос, но он оказывается решающим и приводит к новым результатам».

Огромный научный прорыв скоро произойдёт в соединении дисциплин: интеграции биологии с инженерными направлениями: «Недавно перечитывала с сыном «Незнайку» и, знаете, а Носов ведь предсказал будущее: солнечные батареи, машины на сиропе (что такое биоэтанол? тот же сироп)». Человек, как сказал Вербер, может всё.  

Как получить белорусский и норвежский диплом одновременно   

В Беларуси Ольга представляет совместный с Норвегией образовательный проект — Belanoda (Bel — Беларусь, No — Норвегия, Da — данные). Около шести аспирантов биологического факультета, факультета радиофизики БГУ и института проблем информатики НАН Беларуси смогут поступить в аспирантуру в Норвегии и получить белорусский и норвежский дипломы одновременно.

— Основная наша цель — научить биологов, физиков и химиков понимать друг друга. Они останутся специалистами в своих областях, при этом будут говорить на одном языке. Проблема теперешней науки в том, что каждая из дисциплин достигла предела своего развития. И мы находимся на том этапе, когда пора сесть за один стол и начать разговаривать. Все дисциплины интегрируются: биологи работают с оборудованием, в котором много физики, а математики всё чаще сталкиваются с медицинскими и биологическими данными.

Программа аспирантуры включает в себя комплекс учебного материала белорусского и норвежского вузов. Преподаватели обеих сторон будут вести лекции на английском языке. Аспирантам будет оплачена виза, билеты, проживание и выдана стипендия.  

Несколько участников Belanoda продолжат исследование Ольги. Например, аспирантка биофака будет изучать микроорганизмы, привезённые из Антарктики: «Эти организмы могут быть очень ценными для производства некоторых продуктов. Мы будем заниматься их скринингом и смотреть, какие химические компоненты они могут производить здесь и там. Это новое направление для Беларуси, но со временем оно станет актуальным и здесь».

А в августе в рамках этого же проекта будет организована летняя школа в области анализа данных в биологии. Около 20 белорусов смогут посетить Норвегию и познакомиться с норвежскими студентами.

«В науке я не чувствую, женщина я или мужчина»

По словам Ольги, в Беларусь её привели ностальгия по родине и родному факультету: «Эмиграция — это неизлечимая болезнь. Когда я узнала, что есть возможность поработать с Беларусью, то сразу же предложила это норвежской стороне. Для меня было важно открыть для Норвегии нашу Синеокую. Сейчас я сотрудничаю с преподавателями, которые меня учили, и это приятно».

— Многие спрашивают: что, вербовать приехала? Я не вербую, а даю людям возможность. Безусловно, каждый сам выбирает, нужна она ему или нет. Если специалисты уезжают из страны, то двум-трём людям это не исправить, нужно создавать благоприятные условия и решать проблему на уровне университетов и государства. Плюс не лишним будет узнать у индустрии, нужно ли ей столько биологов, сколько выпускает вуз?

По мнению Ольги, необходимо повышать престиж науки. Если мотивация — зарплата, значит нужно привести её до того уровня, который могут предложить частные компании. В Европе тоже есть такая проблема, но там разрыв не такой глобальный. Зато, по словам белоруски, в скандинавской науке женщина чувствует себя прекрасно: «Там во всём присутствует равенство. Для женщины много открытых дверей. Работая в науке, я вообще не чувствую, женщина я или мужчина».

Продлить жизнь? А зачем?

На вопрос, как победить старость, белоруска отвечает, что лучше попытаться понять этот процесс и научиться с этим жить: «Старость — это естественный процесс. Ошибка человека — выделять себя из природы. Продлить жизнь можно, но к чему это приведёт, что будет потом?».

Вероятно, эффективней было бы подумать о том, что мы можем сделать, чтобы жить долго и качественно в рамках сроков, отведённых природой.

— Мы слишком много испытываем стресса, который даже не осознаём. Наш мозг в принципе не отдыхает: постоянный поток input и output информации. В Скандинавии люди в свои 85 играют в теннис не хуже 25-летних. А всё почему? Потому что они ведут размеренный образ жизнь, у них отведено время и на работу, и на отдых. Я тоже так начала делать: раз в год беру паузу и уезжаю туда, где есть море, солнце и покой. Остановиться и подумать — это важно. 

Оставаться надолго в родных краях она не планирует. «Я человек планеты, а не страны, — отвечает она. — Движущая сила для меня — это работа». 

 

Фото: Андрей Давыдчик

Читайте также: Человеку не перешагнуть биологический лимит своего вида без технологий 

Читайте также
Почти все маркетологи полагаются на ИИ, несмотря на частые ошибки
Почти все маркетологи полагаются на ИИ, несмотря на частые ошибки
Почти все маркетологи полагаются на ИИ, несмотря на частые ошибки
Чем умнее становится ИИ, тем эгоистичнее он себя ведёт
Чем умнее становится ИИ, тем эгоистичнее он себя ведёт
Чем умнее становится ИИ, тем эгоистичнее он себя ведёт
Больше половины американцев считают, что в школах нужно перестать учить арабским цифрам
Больше половины американцев считают, что в школах нужно перестать учить арабским цифрам
Больше половины американцев считают, что в школах нужно перестать учить арабским цифрам
5 комментариев
Учёные создали VR-игру, которая учит справляться со стрессом
Учёные создали VR-игру, которая учит справляться со стрессом
Учёные создали VR-игру, которая учит справляться со стрессом

Хотите сообщить важную новость? Пишите в Telegram-бот

Главные события и полезные ссылки в нашем Telegram-канале

Обсуждение
Комментируйте без ограничений

Релоцировались? Теперь вы можете комментировать без верификации аккаунта.

Комментариев пока нет.